Отдел компьютерного молекулярного дизайна
заведующий отделом
главный научный сотрудник, доктор химических наук
Вениамин
Юрьевич Григорьев
E-mail: beng@ipac.ac.ru
Отдел компьютерного молекулярного дизайна является
мировым лидером в области применения параметров водородной связи
в КССА исследованиях, ADME/Tox и дизайне лекарственных препаратов.
Мы предлагаем полное количественное описание
водородного связывания на
базе оригинальных потенциалов водородной связи.
В состав отдела входят следующие подразделения:
Лаборатория количественной связи структура-свойствоГруппа термодинамики межмолекулярных взаимодействий
Группа молекулярного моделирования
Лаборатория прикладной спектроскопии
В лаборатории количественной связи структура-активность проводятся исследования в области КССА (количественные описания молекулярной структуры с помощью физико-химических дескрипторов, включая параметры водородной связи), моделирование распределения химических веществ в различных системах растворитель-вода-воздух, изучение токсического действия химических веществ по отношению к водным организмам (экотоксичности), моделирование адсорбции и распределения лекарств в органах и тканях человека и их биологической активности.
В группе термодинамики межмолекулярных взаимодействий проводятся экспериментальные работы исследованию термодинамики межмолекулярных взаимодействий лигандов в различных системах, расчет коэффициентов распределения химических веществ в системах растворитель-вода-воздух, расчеты энергии сольватации в воде и других растворителях.
Основной задачей лаборатории прикладной спектроскопии является сервисное обеспечение ЯМР-, ИК- и масс-спектрами синтезирующих подразделений института. Одновременно в лаборатории ведется работа по идентификации и установлению структуры органических соединений, синтезированных по институтской тематике, а также в сотрудничестве с другими научными организациями (МГУ, ИПХФ и др.), изучение механизмов химических реакций в ходе синтеза соединений, обладающих определенной физиологической активностью. Проводятся исследования нековалентных взаимодействий в конденсированных средах методами динамического полиядерного ЯМР и ИК-спектроскопии: комплексообразование, катализ, сольватация, природа водородной связи, образование водо-водородных наноструктур в аморфных и кристаллических твердых телах, их влияния на строение и свойства вулканических стекол и минералов в рамках Q-спецификации. Разработана, отлажена, постоянно совершенствуется программа экспертной системы, идентифицирующей структуру молекулы по базам данных спектров протонного магнитного резонанса (ПМР) и ЯМР 13С. Спектральные базы данных постоянно расширяются. Созданы алгоритмы и программы расчета разнообразия химических соединений и компрессии ИК-спектров.